O objetivo geral do MGTIS é contribuir para a formação de profissionais capazes de produzir novos conhecimentos, tecnologias e inovação em saúde, de modo a promover a qualificação dos processos de gestão da atenção, do trabalho e da educação na saúde.

- Capacitar profissionais inseridos no trabalho em saúde para uma prática: (a) orientada às necessidades sociais e demandas organizacionais e do mercado de trabalho locorregional e nacional; (b) investigativa e científica na produção de conhecimento, de tecnologia e de inovação na gestão da atenção à saúde, do trabalho em saúde e do conhecimento e da educação na saúde; (c) transformadora, pela busca de melhorias na eficiência, efetividade, eficácia e qualidade no cuidado à saúde.
- Realizar pesquisas que possam subsidiar a produção do conhecimento relacionados ao desenvolvimento de tecnologias e a promoção de inovação em saúde, bem como sirvam de apoio à formação de futuros pesquisadores.