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Descrição do projeto

Instituição proponente região:
SUDESTE

Instituição proponente uf:
SP

Instituição proponente município:
São Paulo

Status do projeto:
Em execução

Projeto valor final [último valor do projeto aprovado e publicado]:
R$ 5.325.073,44

Objetivos

▪ Comparar os achados referentes à caracterização clínica e epidemiológica dos pacientes com CECP com menos de 40 anos, e/ou não tabagistas e etilistas com o perfil clínico e epidemiológico da população mundial em geral revista em literatura e de diferentes centros de oncologia no Brasil;
▪ Identificar a prevalência de HPV nessa população, e correlacionar com os dados conhecidos para a população mundial e de outros centros brasileiros;
▪ Avaliar a trajetória nos serviços de saúde e o tempo até o diagnóstico e tratamento dos pacientes com CECP, e comparar de acordo com faixas etárias;
▪ Verificar o impacto na qualidade de vida e na produtividade no trabalho de pacientes após o tratamento por CECP, através da aplicação de questionários específicos;
▪ Verificar o impacto econômico da doença e tratamento para o indivíduo e sociedade.
▪ Analisar a microbiota da cavidade oral de pacientes jovens e/ou não tabagistas e etilistas para identificar agentes biológicos previamente não associados ao CECP;
▪ Elaborar estratégias de prevenção, detecção e erradicação dos novos patógenos identificados;
▪ Identificar mutações germinativas patogênicas em genes de predisposição ao câncer em pacientes com histórico familiar;
▪ Identificar polimorfismos genéticos associados ao risco, evolução, tratamento e prognóstico da doença e quando possível, relacionar com os dados de perfil de inflamação;
▪ Identificar mutações somáticas e variantes estruturais driver em regiões codificadoras e não codificadoras em pacientes jovens e/ou não tabagistas e etilistas;
▪ Comparar as principais alterações genéticas e epigenéticas encontradas com os achados do TCGA, e compará-las aos achados de pacientes de demais faixas etárias, tabagistas e etilistas;
▪ Verificar expressão diferencial de mRNA e RNAs não codificantes (microRNAs e lncRNA) em pacientes com linfonodos comprometidos e não comprometidos;
▪ Identificar potenciais transcritos alvo dos ncRNA circulantes em plasma, através de ferramentas de bioinformática;
▪ Determinar a expressão dos transcritos identificados pela análise in silico, em células metastáticas no linfonodo;
▪ Relacionar os microRNAs diferentemente expressos com os respectivos alvos moleculares envolvidos nos processos biológicos através da análise de marcadores imunoistoquímicos;
▪ Correlacionar dados clínicos com as alterações moleculares encontradas.
▪ Selecionar e otimizar a análise de peptídeos referentes às proteínas-marcadoras das populações de células do sistema imune - neutrófilos, monócitos, células NK e linfócitos T CD8+, células T CD4+ - por proteômica baseada em alvos utilizando monitoramento seletivo de reações (SRM);
▪ Quantificar por SRM as proteínas que caracterizem as populações de células do sistema imune em papa leucocitária de pacientes com CE oral;
▪ Correlacionar a abundância das proteínas-marcadoras com os desfechos clínicos;
▪ Selecionar as proteínas-marcadoras com potencial de classificação e construir um modelo preditivo;
▪ Correlacionar a abundância das proteínas-marcadoras selecionadas com análise de quantificação e caracterização baseada em citometria de fluxo para validação dos anticorpos;
▪ Desenvolver um ensaio de ELISA quantitativo baseando-se nas proteínas-marcadoras selecionadas;
▪ Validar o modelo preditivo em amostras independentes;
▪ Transferir o método de ELISA quantitativo para prover acessibilidade do teste aos laboratórios de medicina diagnóstica;
▪ Estudar a expressão de SET, PP2A e c-Myc em amostras de câncer de orofaringe por imunohistoquímica;
▪ Determinar a frequência de populações mielóides e linfóides circulantes em sangue periférico;
▪ Comparar o perfil de expressão gênica e proteômica entre células mononucleares de sangue de pacientes com câncer de orofaringe e voluntários clinicamente saudáveis;
▪ Determinar a frequência de populações mielóides com fenótipo supressor em sangue periférico de pacientes com carcinoma de orofaringe e estudo da expressão de STAT3 e NFκB nas PBMCs;
▪ Determinar a expressão de STAT3 e p65 NFκB em carcinoma orofaríngeo para comparação com dados sistêmicos;
▪ Avaliar a expressão protéica do YAP/TAZ nos CECP e correlacionar com os parâmetros clínicos e histopatológicos, em especial com os subtipos histológicos;
▪ Avaliar a expressão protéica de TGF-β e WNT e correlacioná-la com a expressão protéica do YAP/TAZ e os parâmetros clínicos, histopatológicos, presença de fibrose e inflamação no microambiente tumoral e padrões de invasão.
▪ Estabelecer cultura primária de células de CECP;
▪ Avaliar sensibilidade de CECP a fármacos, usados e/ou com potencial uso na prática clínica, em modelo de PDX em Zebrafish;
▪ Avaliar sensibilidade de CECP a fármacos em modelo de PDX com camundongos.
▪ Verificar a eficiência e aplicabilidade do uso de ctDNA em plasma e saliva no seguimento e prognóstico do paciente;
▪ Avaliar a expressão de ncRNAs previamente identificados no tecido tumoral, em vesículas extracelulares do tipo exossomal circulantes em plasma e saliva;
▪ Verificar a eficiência e aplicabilidade da quantificação e caracterização molecular de vesículas extracelulares no prognóstico do CECP;
▪ Comparar o desempenho de métodos de biópsia líquida baseados na análise de plasma e saliva e de ctDNA e vesículas extracelulares.